Kreshnik Gjinali är svensk polis, men en gång flydde han från diktaturens Albanien. Nu är han tillbaka för att få fast Shaqir Goçi, den man som under kommunisttiden var lokal chef för den fruktade säkerhetstjänsten och som var ansvarig för Kreshniks fars död i fängelset. Efter diktaturens fall har Goqi etablerat sig som ledare för en hänsynslös brottsorganisation.
I flyktens skugga är en spänningsroman som är inspirerad av verkliga händelser. Den utspelar sig till stor del i Albanien, Europas mest gåtfulla land. Författaren Stefan Nilsson har upplevt landets förvandling från hård kommunistdiktatur, genom kaoset på 90-talet då den organiserade brottsligheten växte fram och till dagens sköra demokrati.